Vers un référentiel national des séquences génétiques des espèces des territoires français

En collaboration avec un consortium scientifique, PatriNat a coordonné une note préalable concernant la mise en place d’un référentiel national des séquences génétiques. Elle a pour objectifs principaux :

• d’identifier et caractériser les besoins et les enjeux relatifs à la création d’un référentiel de séquences génétiques relevant du système d’information sur la biodiversité (SIB) ;

•  de faire un état des lieux des dispositifs existants susceptibles de contribuer à la constitution de ce référentiel ;

• de proposer une préfiguration du référentiel de séquences génétiques. 

Dans le cadre de la recherche et de politiques publiques, le référentiel national de séquences vise à :

• améliorer et objectiver la fiabilité des assignations taxinomiques dérivées des analyses d’échantillons environnementaux ou de spécimens obtenues par des techniques moléculaires ;

• Améliorer la qualité des données d’occurrence provenant d’analyses moléculaires portant sur les espèces présentes dans les territoires français, en faciliter l’accès, l’interopérabilité et leur réutilisation ;

•  mutualiser les efforts de construction, maintenance et alimentation des bases de séquences en proposant un référentiel unique, public et partagé.

Si le référentiel traite en priorité les groupes ciblés par les politiques publiques, il concerne en réalité toutes les espèces Eucaryotes (Hexagone, Corse et Outre-mer) présentes ou ayant été présentes, natives ou introduites, et les espèces non présentes sur le territoire pour lesquelles la France met en place un dispositif spécifique de surveillance. La création de ce référentiel national représente ainsi un enjeu pour l’inventaire, le suivi et la surveillance de la biodiversité et in fine pour la conservation de la biodiversité.

Référence

• Lacoeuilhe A., Denys G., Dupont P., Archambeau A.-S., Bed’Hom B., Bouix T., Brisset J., Cammas M., Dettaï A., Dusoulier F., Gachon C., Gargominy O., Gaudeul M., Haÿ V., Herard K., Le Bras Y., Le Gall L., Maurel N., de Mazancourt V., Mennesson M., Pamerlon S., Poncet R., Puillandre N., Rougerie R., Samadi S., Sire L., Vinet C., Poncet L. & Touroult J., 2025. Référentiel des séquences génétiques des espèces de France : note pour la mise en place d’un nouvel outil national. PatriNat (OFB-MNHN-CNRS-IRD), 32 pp.

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