Réaliser ou coordonner des expertises ponctuelles sur des espèces.
Outre la conduite de programmes visant à mieux connaître les espèces (répartitions, statuts, risques d’extinction, etc.) et à élaborer des outils d’aides à la décision, l'UMS peut être amenée à réaliser ou coordonner des expertises ponctuelles sur des espèces. Dans un premier temps, les experts mobilisent les informations rassemblées par l'UMS au cours des années. L’expertise est donc l’un des processus de valorisation des données de l’INPN. Si les ressources en expertise sont insuffisantes, des experts sont recherchés hors de l'UMS, en premier lieu parmi les chercheurs du MNHN. Les expertises conduites ou coordonnées par l'UMS concernent la métropole comme l’outre-mer et les milieux continentaux comme marins.
L’expertise porte en particulier sur l’élaboration de listes d’espèces (arrêtés de protection, listes d’espèces exotiques envahissantes, d’espèces sensibles au climat, typiques d’habitats, pertinentes pour la TVB, etc.). Elle porte également sur la désignation d’espaces protégés. Ainsi, l'UMS a rendu des avis sur des projets de Parc nationaux ou de classement de zones humides RAMSAR en évaluant le niveau de patrimonialité spécifique des espaces candidats (richesse spécifique, présence d’espèces menacées ou originales, responsabilité patrimoniale…). Il vérifie aussi la cohérence du contenu scientifique des FSD dans le cadre de Natura 2000 (volet oiseaux). Plus globalement, l'UMS a expertisé la cohérence du réseau d’espaces protégés pour certaines espèces dans le cadre de la SCAP.
L’expertise peut également consister à rendre des avis ou à fournir des compléments d’informations sur des plans nationaux d’action ou des études relatives à des projets de grands travaux (centrale nucléaire de Penly, port autonome du Havre…). Par exemple, pour ce dernier, l'UMS a rendu un avis sur un rapport final présentant les résultats des inventaires avifaunistiques et mammalogiques menés sur le site concerné par le projet d’extension des infrastructures portuaires et de prolongement du Grand Canal du Havre. L’expertise peut enfin répondre à des questions très précises du Ministère chargé de l’environnement, comme ce fut le cas pour les petits carnivores, l’Ours brun ou, récemment, le Loup gris. Pour ce dernier, il a été demandé à l'UMS de coordonner une expertise collective visant à évaluer la viabilité à long terme de l'espèce. Plus ponctuellement, les experts peuvent vérifier des listes d’espèces (taxonomie, cohérence espèce-lieu d’observation…) ou les identifier à partir de spécimens, de photographies ou divers indices de présence. Les experts répondent donc à des demandes externes mais aussi internes, en appui transversal à des programmes pilotés par l'UMS.